Căn cứ theo Khoản 5, Điều 13 Nghị định 125/2020/NĐ-CP quy định về việc xử phạt vi phạm hành chính về thuế, hóa đơn đối với hành vi nộp hồ sơ khai thuế quá thời hạn trên 90 ngày sẽ bị phạt từ 15.000.000 đến 25.000.000 đồng kể từ thời điểm sau:

– Hết hạn nộp hồ sơ khai thuế;

– Có phát sinh số thuế phải nộp và người nộp thuế đã nộp đủ số tiền thuế, tiền chậm nộp vào ngân sách nhà nước trước thời điểm cơ quan thuế công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế;

– Thời điểm cơ quan thuế lập biên bản về hành vi chậm nộp hồ sơ khai thuế.

Ngoài ra, người vi phạm phải buộc nộp đủ số tiền chậm nộp tiền thuế vào ngân sách nhà nước.